自民党总裁菅义伟于9月16日在临时国会上被选为日本第99任首相，并成立了自民、公明两党组成的联合内阁。菅内阁“继承”安倍前政权的“衣钵”，副总理兼财务大臣麻生太郎等8名前阁僚则继续连任，同时也有职位调整以及重新入阁的情况。此次组阁突显出了继续前政权之“安全行驶”的态势，当前目标仍是以新冠肺炎疫情的防控工作为首要任务，同时兼顾经济活动。
菅首相在16日晚上的就任记者会中明确表示：“将切实继承安倍前政权一直以来所推行的举措，并继续向前推进。”
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除首相外的20名阁僚中，除了麻生以外，连任的还有外务大臣茂木敏充、负责疫情防控的经济再生大臣西村康稔、公明党出身的国土交通大臣赤羽一嘉等8人；官房长官加藤胜信等3人则进行了职位调整；首次入阁的有5位新人；女性阁僚由前内阁的3人变为2人。新内阁的平均年龄较上届内阁成立时稍有下降，为60.4岁。
另外，有改革意愿的河野太郎由防卫大臣调任为行政改革担当大臣，由此可见今后将致力于实现其提出的“打破垂直分裂行政”的改革态势。为了实现行政数字化，首相还表明，将新设立“数字厅” 的计划，其担当大臣由前IT担当大臣平井卓也负责。
